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A coleção de Pedologia do IICT tem origem no antigo Centro de Estudos de Pedologia Tropical (CEPT, 1960-1983) e é constituída por um vasto espólio (com amostras e/ou monólitos de solo, registos em carta dos percursos efetuados no campo, verbetes de campo com descrição morfológica e folhas laboratoriais com resultados de análises químicas e mineralógicas para cada perfil de solo, fotos de aspetos locais e/ou de trabalhos desenvolvidos) recolhido a partir da década de 40 pela antiga Junta de Investigações Científicas do Ultramar (JICU).
Durante as Missões de Pedologia de Angola (MPA) e Moçambique (MPAM), criadas em 1953 e 1964, foram descritas e estudadas cerca de 26.000 amostras de solo destes países.
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A Missão de Estudos Agronómicos do Ultramar MEAU (1960-1983) foi criada para efetuar estudos agronómicos de base necessários ao desenvolvimento da agricultura e atividades correlativas nas antigas colónias, tendo estabelecido estações agrícolas e campos experimentais. Além de estudos pormenorizados do clima e da vegetação, destacam-se os estudos de fertilidade dos solos, a condução técnica de culturas tropicais, assim como a introdução de novas variedades.
A coleção de solos da MEAU é constituída por 3.261 amostras provenientes de Moçambique, Cabo Verde, Guiné, São Tomé e Príncipe, Índia, Macau e Timor.
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